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厦门大学医学院吕晓雯教授课题组2022年招聘表观遗传学方向博士后

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一、导师个人介绍

吕晓雯教授:博士生导师,厦门大学“南强青年拔尖人才”。主要研究遗传信息对胚胎发育的调控及环境压力诱发的遗传信息重塑对后代发育及健康的影响。通过建立适用于少量稀有细胞的高通量多组学测序方法及生物信息分析新策略在早期胚胎发育及器官发生过程中挖掘诱导基因表达调控网络重排的重要分子及其作用机制。已在science,cell stem cell, molecular cell,cell research, cell reports,nucleic acids research等国际权威学术刊物上发表研究论文十余篇。长期在人类胚胎干细胞分化及应激等体系中研究基因表达调控及染色质高维结构,在表观遗传学领域具备相当的科研经验积累。在博士阶段escs体外肝向分化模型发现了时空特异性激活肝胰标志性基因的增强子序列的作用机制(journal of molecular cell biology, 2012,共同一作)。在博后阶段优化了包括hi-c、hi-chip、atac-seq在内的多组学测序技术,提高了干细胞等少量细胞文库的信噪比及分辨率等质量指标,并通过整合并串联多种生信分析工具对多组学信息进行了深度的挖掘,先后在escs等多能干细胞及其它物种中发现了染色质区室化及新生转录、hptm间的相关性(cell stem cell, 2016; molecular cell封面文章, 2017; cell reports, 2017; nucleic acids research, 2017;molecular cell封面文章, 2019;stem cell reports, 2019)。对异染色质相关蛋白如polycomb复合物等的转录调控功能及参与染色质远程互作的机制进行了长期的研究(molecular cell封面文章, 2015,共同一作;cell reports, 2019;)。此外,对染色质开放性、时空特异性tf,染色质remodeling和hptm的crosstalk及其对se等增强子序列活性的调控有相当多的研究(molecular cell, 2018, 一作)。在发表上述工作后,申请人受邀与博后导师一起为发明crispr-go(人工介导特定染色质位点与核内无膜细胞器标志性蛋白的远程互作)技术的cell论文撰写了专题报道(cell research, 2019, 一作),推荐将crispr基因编辑介导染色质远程互作的技术作为验证染色质区室化功能的重要手段。近期又与4d nucleome团队合作发现人类基因组中活性染色质区室对dna复制较为敏感,而h3k9me3密集分布的一类特殊异染色质能够不依赖于dna复制机制在新合成的基因组中忠实保留h3k9me3修饰及特殊的异染色质区室结构(science,2021,共同一作)。

二、研究领域

发育过程中表观遗传信息通过控制时空特异性基因的有序表达精确调控细胞的命运。本课题组主要研究胚胎发育及胚胎干细胞定向分化过程中基因表达谱重编程的表观遗传调控机理,重点关注增强子、绝缘子等转录调控元件序列在细胞命运决定过程中通过染色质微环境及染色质远程互作对靶基因转录水平的调控作用。通过优化并开发生物信息分析流程提出新的理论模型,采用最新的基因编辑技术并优化多组学文库构建技术对模型进行生物学功能验证,为理解发育及疾病发生等过程中细胞功能特征的转变提出新的思路。

主要研究方向:

1.在escs的定向分化过程中,研究染色质区室化的形成及变化规律,验证核内大分子“相分离”在区室形成过程中的作用。

2.在escs的定向分化过程中,研究增强子-启动子远程互作的形成及变化规律,挖掘参与时空特异性远程互作的新分子及其作用机制。

3.研究异染色质特殊的染色质高维结构在escs的定向分化过程中渐变对细胞分化潜能的影响,并判断其变化对细胞周期的依赖性。

4.开发新的生物信息算法工具和分析流程,获得更高分辨率的各层次表观遗传信息的并解读其相互间的关系对基因表达谱的影响。

三、招聘条件

申报人应具有遵守中华人民共和国的法律法规,认可并承诺遵守厦门大学校规校纪,具有良好的思想政治素质和道德品德,身心健康,能够全职在校工作,并符合以下条件:

方向一:分子生物学/遗传学/生物化学等相关专业背景,获得或即将获得博士学位;熟练掌握分子生物学、细胞培养、基因编辑等基本常规实验操作技术。

方向二:应用数学/统计学/物理学/计算机等相关专业背景,获得或即将获得博士学位;具备扎实的生物信息数据分析能力及丰富的分析经验,熟练掌握linux基本命令及python、perl、c、java、r等语言中的几种。

其它要求:

1)热爱科研,身心健康,能长期稳定工作;

2)诚信踏实、责任心强,善于沟通表达,富有团队合作精神;

3)专业英文听说读写能力强,具备查阅英文文献的能力;

4)在sci期刊以主要作者身份发表过研究论文。

5)年龄在35周岁以下。

四、支持政策

1. 薪酬及福利:提供具有竞争力的薪酬(具体面议),主要包含学校、学院、合作导师配套薪资,享受厦大教职工同等福利待遇;

2. 住房:提供博士后公寓或租房补贴;

3. 子女就学:博士后子女按学校教职工子女同等待遇办理入园、入学;

4. 学术头衔:博士后在站期间,给予特任助理研究员、特任副研究员学术头衔,特别优秀者,可申报厦门大学南强青年拔尖人才计划,给予特任研究员学术头衔;

5. 留校任职:特别优秀的博士后可根据学校岗位公布情况随时申请聘任教师职务;

6. 其他:入选国家“博士后创新人才支持计划”、“青年人才托举工程”等高水平人才支持计划以及省市级项目的博士后,学校及学院资助将予以叠加发放。

五、应聘方式

应聘者请将个人简历及相关证明材料发送合作导师邮箱:xiaowenlyu@xmu.edu.cn,同时抄送一份至医学院人事办公室邮箱:yxyrs@xmu.edu.cn,请写明“应聘博士后+xx课题组 ”;学院将对应聘者的材料进行筛选、评估,通知意向人选面试。

医学院人事办公室联系人:黄老师

联系电话:+86-592-2184469

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